Im Multiplex Mode wird von der lokalen QonnexONE eine andere QonnexONE als MLTX-Client aufgerufen. Nach erfolgter Verbindung können sämtliche Kanäle miteinander verbunden werden.

Dadurch entsteht eine besondere Art der Kommunikation zwischen beiden Maschinen. Eine QonnexONE fungiert als Master, die andere als Slave. Der Multiplex Mode erlaubt, mehrere Spuren gleichzeitig zu übertragen, z.B. Livemischungen auf Outboard Equipment vorzunehmen und Projekte mit Surroundmischungen zu überspielen.